Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms