Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RCE1Q9Y256 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCE1Q9Y256 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms