Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms