Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF18Q9UNG2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms