Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMYND8Q9ULU4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMYND8Q9ULU4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMYND8Q9ULU4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMYND8Q9ULU4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMYND8Q9ULU4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms