Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO4Q9UKT5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FBXO4Q9UKT5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms