Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD2Q9UKL4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms