Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms