Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms