Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEC2Q9UBF1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEC2Q9UBF1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms