Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNMT3BQ9UBC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms