Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD2Q9UBB5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms