Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHRF1Q9P1Y6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms