Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms