Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCMF1Q9P0J7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms