Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOP53Q9NZM5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms