Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms