Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms