Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC17Q9NVM6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms