Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms