Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms