Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RPRMQ9NS64 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms