Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms