Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 INTS11-238ENST00000530233 595 ntTSL 423.84■■□□□ 1.413e-7■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.328e-16■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 ST20-MTHFS-202ENST00000494999 632 ntTSL 334.74■■■■□ 3.158e-16■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.458e-16■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.278e-16■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 CDK19-205ENST00000460913 448 ntTSL 520.82■□□□□ 0.924e-8■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.994e-8■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.454e-9■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 230.81■■■□□ 2.524e-9■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 524.67■■□□□ 1.544e-9■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.434e-9■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.312e-10■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-10■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 COL18A1-205ENST00000423214 839 ntTSL 525.36■■□□□ 1.659e-7■■■■□ 19.4
DROSHAQ9NRR4 KLC1-211ENST00000538504 822 ntTSL 235.17■■■■□ 3.224e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-226ENST00000557686 535 ntTSL 333.35■■■□□ 2.934e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.94e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.244e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.224e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.044e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.664e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 329.24■■■□□ 2.272e-9■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.162e-9■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.032e-9■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.972e-9■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.672e-9■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)22.95■■□□□ 1.262e-9■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-27■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 237.45■■■■□ 3.593e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 237.35■■■■□ 3.573e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.313e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.223e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.833e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.023e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-10■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-10■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-27■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.762e-27■■■■□ 19.3
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.433e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.153e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.923e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.653e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.128e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-213ENST00000490608 631 ntTSL 222.76■■□□□ 1.236e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.568e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 324.8■■□□□ 1.568e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-210ENST00000529717 705 ntTSL 529.93■■■□□ 2.382e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-202ENST00000524786 475 ntTSL 423.57■■□□□ 1.362e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-209ENST00000528864 557 ntTSL 415.19■□□□□ 0.022e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.352e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.122e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 433.09■■■□□ 2.892e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)28.23■■■□□ 2.112e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 526.39■■□□□ 1.822e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 325.72■■□□□ 1.712e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.482e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 323.61■■□□□ 1.372e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FKBP8-214ENST00000609656 220 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 533.16■■■□□ 2.96e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 232.96■■■□□ 2.876e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 530.8■■■□□ 2.526e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.725e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PSMD7-206ENST00000568717 1395 ntTSL 229.64■■■□□ 2.345e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PSMD7-203ENST00000566015 537 ntTSL 229.18■■■□□ 2.265e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.55e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-243ENST00000522958 580 ntTSL 221.39■■□□□ 1.022e-32■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-241ENST00000521790 549 ntTSL 211.76□□□□□ -0.532e-32■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 544.55■■■■■ 4.726e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-209ENST00000437652 911 ntTSL 340.59■■■■■ 4.091e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-205ENST00000412596 980 ntTSL 540.58■■■■■ 4.091e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.036e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 GPR162-207ENST00000545321 683 ntTSL 239.59■■■■□ 3.938e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 237.68■■■■□ 3.626e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 537.51■■■■□ 3.596e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-203ENST00000446777 560 ntTSL 537.25■■■■□ 3.556e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.528e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.491e-12■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.426e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 234.94■■■■□ 3.186e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7B-206ENST00000487542 873 ntTSL 234.94■■■■□ 3.186e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 NIPSNAP1-202ENST00000415100 661 ntTSL 534.79■■■■□ 3.161e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)33.61■■■□□ 2.976e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.858e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 NIPSNAP1-206ENST00000496944 586 ntTSL 232.81■■■□□ 2.841e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-210ENST00000475757 1073 ntTSL 232.49■■■□□ 2.796e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.741e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.73e-9■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SMC6-210ENST00000621152 500 ntTSL 331.59■■■□□ 2.656e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.56e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.486e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7B-204ENST00000461530 658 ntTSL 430.51■■■□□ 2.476e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.476e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-204ENST00000372157 855 ntTSL 530.46■■■□□ 2.476e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-205ENST00000471524 879 ntTSL 330.44■■■□□ 2.466e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.436e-7■■■□□ 19.2
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