Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms