Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms