Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms