Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms