Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPR88Q9GZN0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms