Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms