Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR12Q9C0I1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms