Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4CQ9C0C4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms