Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PECRQ9BY49 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms