Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP1Q9BWH6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP1Q9BWH6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms