Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms