Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms