Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms