Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TXNDC17Q9BRA2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TXNDC17Q9BRA2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms