Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA1CQ9BQE3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms