Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 IPT1YDR072C 1584 nt2.29□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 RTP1YMR185W 2946 nt2.29□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 NCL1YBL024W 2055 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 BNI1YNL271C 5862 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 RPI1YIL119C 1224 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 MSL1YIR009W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 YML108WYML108W 318 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 YOR248WYOR248W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 CDC53YDL132W 2448 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL066CQ99208 RNH70YGR276C 1662 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 FMP16YDR070C 282 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 RPF1YHR088W 888 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 SYM1YLR251W 594 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 GRX8YLR364W 330 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 CAT8YMR280C 4302 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 LYS9YNR050C 1341 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YHR210CYHR210C 1026 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 VPS8YAL002W 3825 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 COA6YMR244C-A 315 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YMR320WYMR320W 306 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 SWT1YOR166C 1377 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 MGA2YIR033W 3342 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 SMD1YGR074W 441 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 VOA1YGR106C 798 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 PAU8YAL068C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 RPS17AYML024W 411 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 PAU20YOL161C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 snR54snR54 86 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 CDC60YPL160W 3273 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 AFI1YOR129C 2682 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 MUD2YKL074C 1584 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 UTP30YKR060W 825 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 IRC19YLL033W 693 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 DDR48YMR173W 1293 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 VPS35YJL154C 2835 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 CDC24YAL041W 2565 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 ELG1YOR144C 2376 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YDL041WYDL041W 354 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YKL111CYKL111C 336 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YPL205CYPL205C 345 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 CHS1YNL192W 3396 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 RVS161YCR009C 798 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 NOP10YHR072W-A 177 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 VTI1YMR197C 654 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 SPO22YIL073C 2928 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 AIM29YKR074W 468 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 TEN1YLR010C 483 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 YNL010WYNL010W 726 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 snR13snR13 124 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 RRP6YOR001W 2202 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL066CQ99208 IRC10YOL015W 1761 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 VPS52YDR484W 1926 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 MZM1YDR493W 372 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 BFA1YJR053W 1725 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 ECL1YGR146C 636 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 RRF1YHR038W 693 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YKL063CYKL063C 504 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YAR068WYAR068W 486 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YPR039WYPR039W 336 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 RPB5YBR154C 648 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 MSH6YDR097C 3729 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YLR031WYLR031W 561 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 TSC3YBR058C-A 243 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 COG4YPR105C 2586 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 CDC50YCR094W 1176 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 SNC1YAL030W 354 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 SEC22YLR268W 645 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YMR324CYMR324C 243 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 TOM22YNL131W 459 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YNL324WYNL324W 396 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 PPN1YDR452W 2025 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 UTP21YLR409C 2820 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 UBR1YGR184C 5853 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 TOR2YKL203C 7425 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YER121WYER121W 345 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YGR025WYGR025W 303 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YHR125WYHR125W 306 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 SPC29YPL124W 762 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 DOT6YER088C 2013 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 HUR1YGL168W 333 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 RUF22RUF22 515 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YPR117WYPR117W 7470 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 YNL144CYNL144C 2223 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 SPC72YAL047C 1869 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL066CQ99208 ATP17YDR377W 306 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL066CQ99208 VAR1Q0140 1197 nt2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.3 ms