Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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