Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms