Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms