Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA5Q96PV4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms