Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms