Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC43Q96MW1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms