Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms