Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms