Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD8Q96LT4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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