Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR3Q96KR7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms